為實施創新驅動發展戰略，支撐云南有色金屬支柱產業發展，解決云南省復雜有色金屬資源選冶基礎理論、關鍵技術及裝備、提高資源綜合利用率等方面的問題，建設區域高水平大學，云南省科技廳提出云南省與科技部共同支持昆明理工大學建設復雜有色金屬資源清潔利用國家重點實驗室，并于2013年科技部與云南省工作會商初步達成共識。2014年經遴選論證，科技部和云南省人民政府共同發文批準“部省共建復雜有色金屬資源清潔利用國家重點實驗室”，這是云南省第一家獲批建設的部省共建國家重點實驗室，也是第一家依托云南高等學校建設的國家重點實驗室。      
    部省共建國家重點實驗室，順應深化科技體制改革發展的要求，通過體制機制創新的共建模式，集成了中央和地方的科技資源，共同打造有色金屬產業的國家級創新平臺，有效提升了昆明理工大學的創新能力，為其建設區域性高水平大學提供支撐，對創新驅動云南有色金屬產業發展具有重要意義。