論文專著：

在國內外核心刊物上發表學術論文五十余篇，其中SCI摘錄12篇。

 發表英文論文：

1 DENG X, Hu Z L, Yi X E. continuous treatment process of mercury removal from aqueous solution by growing recombinant E. coli cells and modeling study. Journal of Hazardous Materials.2008, 153(1-2): 487-492.

2 DENG X, Yi X E, Liu G, Cadmium removal from aqueous solution by gene-modified Escherichia coli JM109, Journal of Hazardous Materials, 2007, 139(2): 340-344.

3 Lu Y H, DENG X, Cheng Z J, Li Q B, Liu G, Enhanced production of hybrid extracellular beta-glucanase by recombinant E.coli Using experimental design method. Chinese Journal of Chemical Engineering. 2007, 15(2):172-177.

4 Zheng S Z, He N, DENG X, Li Q B, He Z, Lu Y H, Optimization of medium components for plasmid production by recombinant E.coli DH5α pUK21CMVβ1.2. Biotechnology and Bioprocess Engineering, 2007, 12:213-221.

5 DENG X, Zheng Y C, Li Q B, Effect of Ambient Conditions on Simultaneous Growth and Bioaccumulation of Mercuric Ion by Genetically Engineered E. coli JM109, Journal of Hazardous Materials, 2006, 136(2): 233-238.

6 DENG X, Li Q B, Lu Y H, He N, Genetic Engineering of E.coli SE5000 and Its Potential for Nickel Bioremediation. Process Biochemistry, 2005, 40:425-430

7 Zhao X W, Zhou M H, Li Q B, DENG X (Corresponding author), Simultaneous mercury bioaccumulation and cell propagation by genetically engineered E.coli, Process Biochemistry, 2005, 40:1611-1616.

8 DENG X, Li Q B, Lu Y H, Sun D H, Huang Y L, Bioaccumulation of Nickel from Aqueous Solutions by Genetically Engineered Escherichia coli. Water Research, 2003, 37:2505-2511.

9 Andre G, Kanchanawong P, Palma R, Cho H, DENG X, Computational and Experimental Studies of the Catalytic Mechanism of Thermobifida fusca cellulase Cel6A (E2). Protein Engineering, 2003, 16(2):125-134.

10 DENG X, Wilson D B, Separation of Mercury from Electrolytic Wastewater by Genetically Engineered E.coli. Applied Microbiology and Biotechnology, 2001, 56:276-279.

發表中文論文：

1 光合細菌處理重金屬廢水的研究進展 賈培; 鄧旭 深圳大學生態環境研究所深圳大學生命科學學院 【期刊】工業水處理 2011-01-20

2 利用萊茵衣藻去除污水中氮磷的研究 鄧旭; 魏斌; 胡章立 深圳大學生命科學學院 【期刊】環境科學 2010-06-15

3 基因工程菌生物富集廢水中重金屬鎘 蔡穎; 趙肖為; 鄧旭; 李清彪; 盧英華; 尹濤烽 廈門大學化學工程與生物工程系; 溫州大學應用技術學院; 深圳大學生命科學學院; 廈門大學化學工程與生物工程系 福建廈門; 浙江溫州; 廣東深圳; 福建廈門 【期刊】水處理技術 2006-01-10

4 羊棲菜吸附重金屬的研究 趙肖為; 周茂洪; 鄧旭; 盧英華 溫州大學生命與環境科學學院; 深圳大學生命科學學院; 廈門大學化學與生物化學工程系 浙江溫州; 浙江溫州; 廣東深圳; 福建廈門 【期刊】海洋湖沼通報 2006-03-30

5 重組大腸桿菌發酵生產β1-3,1-4-葡聚糖酶培養基優化研究 程志敬; 鄧旭; 盧英華; 何寧; 陳文謀 廈門大學化學工程與生物工程系; 深圳大學生命科學學院; 廈門大學化學工程與生物工程系 廈門 【期刊】工業微生物 2006-06-30

6 生物合成法生產β-葡聚糖酶 鄧旭; 程志敬; 盧英華 深圳大學生命科學學院; 廈門大學化學工程與生物工程系; 廈門大學化學工程與生物工程系 廣東深圳; 福建廈門 【期刊】生物技術 2006-12-30

7 跨學科選修課生物化工的課程建設及教學方法初探 鄧旭 深圳大學生命科學學院 廣東深圳 【期刊】化工高等教育 2007-06-30

8 轉基因衣藻對重金屬的抗性及對鎘離子的富集 鄧旭; 魏斌; 胡章立 深圳大學生命科學學院; 深圳大學生命科學學院; 深圳大學生命科學學院 廣東深圳; 廣東深圳 【期刊】生物技術 2007-12-15

9 鎘離子的生物富集 趙肖為; 周茂洪; 李清彪; 盧英華; 鄧旭 溫州大學應用技術學院; 廈門大學化工與生物工程系; 深圳大學生命科學學院 溫州 【期刊】離子交換與吸附 2005-08-20

10 微囊藻與細菌VBNC狀態的相關性及其機理 沈菊; 黎雙飛; 雷安平; 鄧旭; 胡章立 【會議】中國海洋湖沼學會藻類學分會第七屆會員大會暨第十四次學術討論會論文摘要集 2007-08-01

11 轉基因萊茵衣藻對重金屬離子的抗性及對鎘離子的富集 魏斌; 鄧旭; 胡章立 【會議】中國海洋湖沼學會藻類學分會第七屆會員大會暨第十四次學術討論會論文摘要集 2007-08-01