張愛兵 ，男， 博士，教授。 現任首都師范大學生命科學學院教授、博士生導師，生態學教研室主任，分子生態學學科帶頭人，國家杰出青年基金獲得者；分子生態學，學科帶頭人 。

教育及工作經歷：

1999,09－2003,07，中科院動物研究所農業蟲鼠害綜合治理研究國家重點實驗室，分子生態學博士研究生，主要研究內容是長江流域及其以南地區松毛蟲不同地理種群空間遺傳結構，基因流及松毛蟲近緣種系統發育的分子系統學重建。

2003,08－2003,10，中國林業科學研究院森林生態環境與保護研究所，助研，從事森林昆蟲種群遺傳學及地理分布研究。

2003,11－2006,10，日本京都大學，博士后, 主要研究方向是東亞地區（韓國，日本，中國）昆蟲分子系統學，分子系統地理學.開發分子譜系地理學進化事件推理軟件AutoInfer1.0（Zhang et al.2006）。

2006,10-2006,12, 中科院動物研究所, 動物進化與系統生物學研究中心（現動物進化與系統學重點實驗室），助研，從事DNA條形碼及分子分類研究。

2007,01－2009,01, 瑞典皇家工學院（生物技術研究所），博士后，主要研究方向分子譜系地理學；開發了應用于DNA分子分類的軟件BPSI2.0（Zhang & Savolainen 2008）。

2009.02- 首都師范大學生命科學學院，教授，分子生態學，學科帶頭人，生態學教研室主任（2010-）。

學術兼職：

現兼任中國昆蟲學會常務理事，《北京昆蟲學會》副理事長、《北京生態學學會》理事，中國昆蟲學會蛾類專業委員會主任，昆蟲生態專業委員會、昆蟲基因組專業委員會、中國林學會森林昆蟲專業委員會委員，國際期刊《Methods in Ecology and Evolution》（生態學I區）副主編，《應用昆蟲學報》、《生物安全學報》、《環境昆蟲學報》編委等。

1、日本進化學會會員（2006-2007）；

2、國際期刊 Molecular Ecology ((SCI IF 6.457; 5Y IF 6.633;ranking 5/34 (Evolutionary Biology), 6/114 (Ecology))) 分子譜系地理學、DNA分子分類方向評審專家（2009-）；

3、著名國際期刊Ecology Letters (SCI IF 15.253 5Y 14.261)擔任審稿( 2009-)；

4、ISI Journal Citation Reports，Ranking: 2008: 4/124 Ecology。

5、《生物安全學報》編委（2010-）。

6、中國昆蟲學會，昆蟲生態專業委員會委員（2013-）。

7、 青年工作委員會委員（2013-）。

8、 中國昆蟲學會昆蟲基因組專業委員會委員（2014-）。

9、《北京市昆蟲學會》理事（2014-）。

10、 中國林學會森林昆蟲專業委員會委員（2014-）。

11、《生態學》雜志編委。

招生信息：

071300 生態學 01 分子生態學（昆蟲對全球變化的響應、入侵昆蟲與本地物種互作等）

071002 動物學 01 鱗翅目昆蟲進化與功能組學

0710J7 生物信息學

（歡迎具有數學、計算機科學、物理、化學、生物信息學、分子生物學等交叉學科背景的優秀學生報考）。

研究方向：

1. 動物遺傳多樣性；

2. DNA分子分類學原理與應用；

3. 分子生態學（分子譜系地理學）；

4. 比較基因組學；

5. 進化與系統發育重建；

6. 害蟲分子識別。

研究領域：

（1）昆蟲學：以昆蟲綱第二大目的鱗翅目昆蟲為主要研究對象，探究生物多樣性的形成和維持機制、植物-昆蟲-微生物互作網絡、昆蟲空間分布與擴散、鱗翅目昆蟲適應性進化等；

（2）入侵昆蟲生態：運用多組學、生態位模型等，聚焦重大鱗翅目入侵害蟲（美國白蛾、草地貪夜蛾等），研究入侵種與本地近緣種競爭互作、入侵種與本地種對全球變化的響應等；

（3）入侵物種智能識別算法開發及入侵風險預警。

研究成果：

主要研究成果在進化、生態學top國際期刊發表，包括，Syst Biol(IF14.21)，Mol Biol Evol(IF14.30,)，Mol Ecol(IF6.54)，Mol Ecol Resour(IF5.62),ProcR SocB（IF5.80)等，其中Syst Biol和Mol Biol Evol分別在46個國際進化生物學期刊中排名第3（ranking3/46，Evolutionary Biology）和第2（ranking2/46，Evolutionary Biology），Mol Ecol和Mol Ecol Resour為國際生態學領域top10期刊（ranking11/141(Ecology)，13/141(Ecology)）。

1. DNA 分子分類學。

在國際上首次把人工智能的思想引入到DNA分子分類學領域，提出了基于BP人工神經網絡的物種鑒定新方法，研究成果被國際同行（審稿人）評價為非常重要的（very significant）,為當前DNA物種鑒定提供了一個即時的，創新性的解決方案（a timely and innovative solution）。研究成果發表在國際系統生物學核心期刊（Top3）Systematic Biology 上(2008,4月刊)（SCI, 2005 Impact Factor: 10.327; SCI IF 8.48; 5Y IF 10.78）。通過計算機模擬及實例研究首次在DNA分子分類領域提出基于物種的取樣策略，指出DNA分子分類研究中人們通常所期望的普適的取樣閾值并不存在，首次提出“單倍型發現曲線”（HDC）的概念，并給出了幾種關鍵取樣量的計算方法，該項研究被四個國際同行（審稿人）中的三個給與了高度評價，一個同行在肯定這項工作的同時，給出了一些批評意見。給項研究已被Molecular Phylogenetic and Evolution（SCI IF 3.56; 5Y IF 4.04）正式接受（ 2009-09-10）。

2. 分子生態學、分子系統學、分子譜系地理學。

運用多基因分子標記的系統發育重建方法，同時運用線粒體和核基因分子標記對朝鮮半島的Coptolabrus亞屬的近緣種的大步甲進行了系統地理學研究，對不同地質歷史時期物種遷移擴散，隔離，局部的基因交流進行了基于分子數據的演化推導，探討了核基因在分子系統地理學推導的作用及局限性；同時，對同域分布于朝鮮半島的Leptocarabus亞屬的近緣種進行了比較系統地理學研究；對分布于日本列島及朝鮮半島的Leptocarabus亞屬進行了基于多個核基因的分子系統學重構。運用線粒體DNA基因組測序的方法首次將狗的世界起源定位于中國長江以南地區，該項研究成果（共同第一作者）最近（2009-09-01）被 Molecular Biology and Evolution ( SCIIF 9.87; 5Y IF 8.22 在線發表（doi:10.1093/molbev/msp195）。

相關及其他研究成果，發表于生態、進化、分子系統學的核心國際期刊Molecular Biology and Evolution ( SCI IF 9.87; 5Y IF8.22)，Molecular Ecology（2005, 2006 Impact Factor: 4.301, 4.825; 5.169），Molecular Phylogenetic and Evolution （SCI IF 3.56; 5Y IF 4.04），Zoological Science (SCI, 2006 Impact Factor: 1.240), Molecular Ecology Notes (2006 Impact Factor:1.220)等。

（備注：已發表論文29篇（SCI收錄15篇），其中2005年至今共發表SCI論文13篇， 以主要作者發表SCI期刊論文累計影響因子為53.29（2005年至今，其中第一作者為37.82）.單篇論文影響因子>8的1篇（5Y IF 8.22），>10的1篇（5Y IF 10.78）.

承擔科研項目情況：

主持國家自然科學基金杰出青年基金項目、面上項目、北京市自然基金重點項目、北京市留學人員擇優資助項目及北京市人才強教“創新團隊”項目等多項。

1. 首都師范大學人才引進項目，2009-2010。

2. “北京及周邊地區鱗翅目森林害蟲DNA條碼監控識別技術” ，北京市自然基金重點項目，2010-2012，項目號：KZ201010028028，主持人。

3. “DNA分子分類中的統計推斷及實驗驗證”，博士啟動基金。

4. 北京市屬高等學校人才強教深化計劃-211學術創新團隊建設計劃項目，2010-項目負責人。

5. 基于DNA序列信息和人工智能識別的昆蟲物種識別研究，項目編號：31071963，國家自然科學基金面上項目1項，2011-2013，項目負責人。

6. 北京市留學人員擇優資助項目1項，2011，項目負責人。

7. 北京市人才強教“創新團隊1項，2011-2013，項目負責人。

8. IFS瑞典國際基金1項（Project: Spatial genetic structure and gene flow of masson pine moth, Dendrolimus punctatus (Walker) in southern China，2001-2002　項目編號：IFS D/3204-1。

9. 國家重點實驗室開放課題1項（中國科學院創新項目，項目名稱：中國南部地區松毛蟲種群暴發的遺傳基礎研究, 項目編號：KSCX2-SW-103: 2001-C-03）。

10. 日本文部科學省及日本學術振興會科研基金一項（Project: Molecular phylogeny, genetic differentiation and phylogeography of some insect groups (ground beetles) in East Asia inferred from mitochondrial and multiple nuclear genes. 項目編號：No. 15003315，2003-2005）。

11. Wenner Gren Foundation (2007-2009); Project: “Early history of the domestic dog: a study of phylogegraphy and phylogeneaology”.(2007~2009, KTH, Sweden)。

12. 國家自然科學基金重大項目（39893360）和國家重點基礎研究發展規劃項目（G2000016210）及國家“九五”科技攻關項目的研究。

13. 溫帶和熱帶地區鱗翅目昆蟲群落建成機制比較研究，2014年北京市百千萬人才工程培養項目，2014。

14. 國家杰出青年科學基金項目： 鱗翅目昆蟲多樣性及群落建成機制研究項目編號：31425023，2014-2018。

        15.松毛蟲DNA分子分類中的模式識別問題  張愛兵  縱向  教育部項目 教育部博士學科點基金，2011-01-01- 2013-12-31。  

16. 北京及周邊地區鱗翅目森林害蟲DNA條碼監控識別技術  張愛兵  專項  北京市教委 ，2010-01-01- 2012-12-31。 

Publicly available computer programs:

1. Zhang, A. B., Tan, S. J. and Sota, T. (2006). AutoInfer1.0: a computer program to infer biogeographical events automatically. Molecular Ecology Notes 6(3): 597-599. Autoinfer is written in C++.

2. Zhang. A. B. and P. Savolainen (2008). BPSI2.0: A C/C++ Interface Program for Species Identification via DNA Barcoding with a BP-Neural Network by calling the Matlab engine. Molecular Ecology Resources. (DOI: 10.1111/j.1755-0998.2008.02372.x;http://www3.interscience.wiley.com/journal/119881759/issue). BPSI2.0 is basically written in C++.

發表英文論文：

[1]Cai-qing Yang; Ying Wang; Xinhai Li; Jing Li; Bing Yang; Michael Orr; Ai-bing ZHANG.Environmental niche models improve species identification in DNA barcoding.Methods in Ecology and Evolution.2024-10-27 | Journal article | Author.DOI: 10.1111/2041-210x.14440

[2]Mingsheng YANG; Ying WANG; Peng DAI; Dandan FENG; Alice C. HUGHES; Houhun LI; Aibing ZHANG.Sympatric diversity pattern driven by the secondary contact of two deeply divergent lineages of the soybean pod borerLeguminivora glycinivorella.Integrative Zoology.2024-10-26 | Journal article.DOI: 10.1111/1749-4877.12917

[3]Mingsheng Yang; Ying Wang; Weili Ding; Houhun Li; Aibing Zhang.Predicting habitat suitability for the soybean pod borer Leguminivora glycinivorella(Matsumura) using optimized MaxEnt models with multiple variables.Journal of Economic Entomology.2024-10-14 | Journal article.DOI: 10.1093/jee/toae167

[4]Yang, B., Zhang, Z., Yang, C. Q., Wang, Y., Orr, M. C., Wang, H., and Zhang, A. B. (2022). Identification of species by combining molecular and morphological data using convolutional neural networks. Systematic Biology, 71(3):690-705. https://doi.org/10.1093/sysbio/syab076.  

[5]Li, J., Yang, Y. M., Wang, Y., Yang, C. Q., Wang, G. F., Wu, C. S., and Zhang, A. B. (2022). Find my way to you: a comparative study of antennal sensilla and olfactory genes in slug moth with different diet ranges (Lepidoptera: Limacodidae). Frontiers in Ecology and Evolution, 10:845922. https://doi.org/10.3389/fevo.2022.845922. (生態學2區，昆蟲與寄主植物互作).

[6]Qi, Mujie; Zhao, Huifeng; Yu, Fang; Zhang, Aibing; Li, Houhun*.The First Mitogenomes of the Subfamily Odontiinae (Lepidoptera, Crambidae) and Phylogenetic Analysis of Pyraloidea.Insects, 2021, 12(6): 486.

[7]Zhang, Xiaoman; Shi, Zhiyong; Zhang, Shaoqian; Zhang, Peng; Wilson, Johnjames; Shih, Chungkun; Li, Jing; Li, Xuedong; Yu, Guoyue; Zhang, Ai-bing*.Plant-herbivorous insect networks: who is eating what revealed by long barcodes using high-throughput sequencing and Trinity assembly.Insect Science, 2021, 28(1): 127-143. https://doi.org/10.1111/1744-7917.12749. 

[8]Li, Jing; Lv, Qing; Zhang, Xiao-man; Han, Hui-lin; Zhang, Ai-bing*.Characterization and Phylogenetic Analysis of the Complete Mitochondrial Genome of Laelia suffusa (Lepidoptera: Erebidae, Lymantriinae).Journal of Insect Science, 2021, 21(1): ieaa138.DOI: 10.1093/jisesa/ieaa138

[9]Yang, Chentao; Zheng, Yuxuan; Tan, Shangjin; Meng, Guanliang; Rao, Wei; Yang, Caiqing; Bourne, David G.; O'Brien, Paul A.; Xu, Junqiang; Liao, Sha; Chen, Ao; Chen, Xiaowei; Jia, Xinrui; Zhang, Ai-bing*; Liu, Shanlin*.Efficient COI barcoding using high throughput single-end 400bp sequencing.BMC Genomics, 2020, 21(1): 862.DOI: 10.1186/s12864-020-07255-w

[10]Hao, Mengdi#; Jin, Qian#; Meng, Guanliang#; Yang, Caiqing#; Yang, Shenzhou; Shi, Zhiyong; Tang, Min; Liu, Shanlin; Li, Yinan; Li, Jing; Zhang, Dan; Su, Xu; Shih, Chungkun; Sun, Yiran; Wilson, John-James; Zhou, Xin*; Zhang, Ai-bing*.Using full-length metabarcoding and DNA barcoding to infer community assembly for speciose taxonomic groups: a case study.Evolutionary Ecology, 2020, 34(6): 1063-1088. DOI: 10.1007/s10682-020-10072-y

[11]Hao, Mengdi; Jin, Qian; Meng, Guanliang; Yang, Caiqing; Yang, Shenzhou; Shi, Zhiyong; Tang, Min; Liu, Shanlin; Li, Yinan; Zhang, Dan; Su, Xu; Shih, Chungkun; Sun, Yiran; Zhou, Xin*; Zhang, Ai-bing*.Regional assemblages shaped by historical and contemporary factors: Evidence from a species-rich insect group.Molecular Ecology, 2020, 29(13): 2492-2510. https://doi.org/10.1111/mec.15412.

[12]Zhang, Sufang; Shen, Sifan; Peng, Jiong; Zhou, Xin; Kong, Xiangbo; Ren, Pingping; Liu, Fu; Han, Lingling*; Zhan, Shuai*; Huang, Yongping*; Zhang, Aibing*; Zhang, Zhen*.Chromosome-level genome assembly of an important pine defoliator, Dendrolimus punctatus (Lepidoptera; Lasiocampidae).Molecular Ecology Resources, 2020, 20(4): 1023-1037.

[13]Zhao, Huifeng; Li, Shuqiang*; Zhang, Aibing*.Taxonomic revision of Telemidae (Arachnida, Araneae) from East and Southeast Asia.ZooKeys, 2020, 933(933): 15-93.

[14]Li, Jing; Lv, Qing; Han, Hui-lin; Zhang, Ai-bing.The complete mitochondrial genome of a tussock moth: Euproctis seitzi (Lepidoptera: Erebidae, Lymantriinae).Mitochondrial DNA Part B-Resources, 2020, 5(2): 1319-1320.

[15]Ai-bing ZHANG.Sixteen Years of DNA Barcoding in China: What Has Been Done? What Can Be Done?Frontiers in Ecology and Evolution.2020-04-06 | Journal article.DOI: 10.3389/fevo.2020.00057

[16]Ai-bing ZHANG.Plant–herbivorous insect networks: who are eating what revealed by long‐arcodes using high‐ hroughput sequencing and Trinity assembly.Insect Science.2019-12-27 | Journal article. DOI: 10.1111/1744-7917.12749

[17]Qin, Jie; Li, Jing; Gao, Qiang; Wilson, John James; Zhang, Ai bing*.Mitochondrial phylogeny and comparative mitogenomics of closely related pine moth pests (Lepidoptera: Dendrolimus).PeerJ, 2019, 7: e7317.

[18]Li, Jing; Jin, Qian; Zhu, Geng ping; Jiang, Chong; Zhang, Ai bing*.Phylogeography of Dendrolimus punctatus (Lepidoptera: Lasiocampidae): Population differentiation and last glacial maximum survival.Ecology and Evolution, 2019, 9(13): 7480-7496.

[19]Zhang Weiting; Li Hu*; Shih Chungkun; Zhang Aibing; Ren Dong*.Phylogenetic analyses with four new Cretaceous bristletails reveal inter-relationships of Archaeognatha and Gondwana origin of Meinertellidae.Cladistics, 2018, 34(4): 384-406.

[20]Shi, Zhiyong#; Yang, Caiqing#; Hao, Mengdi; Wang, Xiaoyang; Ward, Robert D.; Zhang, Aibing*.FuzzyID2: A software package for large data set species identification via barcoding and metabarcoding using hidden Markov models and fuzzy set methods.Molecular Ecology Resources, 2018, 18(3): 666-675.https://doi.org/10.1111/1755-0998.12738.

[21]Jin, Q.; Hu, X. M.; Han, H. L.; Chen, F.; Cai, W. J.; Ruan, Q. Q.; Liu, B.; Luo, G. J.; Wang, H.; Liu, X.; Ward, R. D.; Wu, C. S.; Wilson, J. J.; Zhang, A. B.A two-step DNA barcoding approach for delimiting moth species: moths of Dongling Mountain (Beijing, China) as a case study.Scientific Reports, 2018, 8.

[22]Zhang,Ai-bing#*; Hao,Mengdi#; Yang, Caiqing; Shi, Zhiyong.BarcodingR: an integrated R package for species identification using DNA barcodes.Methods in Ecology and Evolution, 2017, 8(5): 627-634.

[23]Yang,Conghui; Yang, Pengcheng; Zhang, Sufang; Shi, Zhiyong; Kang, Le*; Zhang Ai-Bing*.Identification, expression pattern, and feature analysis of cuticular protein genes in the pine moth Dendrolimus punctatus (Lepidoptera: Lasiocampidae). Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2017, 83: 94-106.

[24]Wang, Ying; Zhou, Qing-Song; Qiao, Hui-Jie; Zhang, Ai-Bing; Yu, Fang; Wang, Xu-Bo; Zhu, Chao-Dong; Zhang, Yan-Zhou*. Formal nomenclature and description of cryptic species of the Encyrtus sasakii complex (Hymenoptera: Encyrtidae). Scientific Reports, 2016, 6: 34372.

[25]Yang, Cong-Hui; Yang, Peng-Cheng; Li, Jing; Yang, Fan; Zhang, Ai-Bing*. Transcriptome Characterization of Dendrolimus punctatus and Expression Profiles at Different Developmental Stages.PLos One, 2016, 11(8): e0161667. 

[26]Luo, Arong; Lan, Haiqiang; Ling, Cheng; Zhang, Aibing; Shi, Lei; Ho, Simon Y. W.*; Zhu, Chaodong.A simulation study of sample size for DNA barcoding.Ecology and Evolution, 2015, 5(24).

[27]Zhang, Lijuan; Li, Hu; Li, Shujuan; Zhang, Aibing; Kou, Fei; Xun, Huaizhu; Wang, Pei; Wang, Ying; Song, Fan; Cui, Jianxin; Cui, Jinjie; Gouge, Dawn H.; Cai, Wanzhi*.Phylogeographic structure of cotton pest Adelphocoris suturalis (Hemiptera: Miridae): strong subdivision in China inferred from mtDNA and rDNA ITS markers.Scientific Reports, 2015, 5: 14009.

[28]Qin, Jie; Zhang, Yanzhou*; Zhou, Xin; Kong, Xiangbo; Wei, Shujun; Ward, Robert D.; Zhang, Ai-bing*.Mitochondrial phylogenomics and genetic relationships of closely related pine moth (Lasiocampidae: Dendrolimus) species in China, using whole mitochondrial genomes.BMC Genomics, 2015, 16: 428. 

[29]Jie Qin; Yanzhou Zhang; Xin Zhou; Xiangbo Kong; Shujun Wei; Robert D Ward; Ai-bing Zhang*.Mitochondrial phylogenomics and genetic relationshipsof closely related pine moth.BMC Genomics, 2015, 16(428).

[30]Tang, Min; Tan, Meihua; Meng, Guanliang; Yang, Shenzhou; Su, Xu; Liu, Shanlin; Song, Wenhui; Li, Yiyuan; Wu, Qiong; Zhang, Aibing; Zhou, Xin*.Multiplex sequencing of pooled mitochondrial genomes-a crucial step toward biodiversity analysis using mito-metagenomics.Nucleic Acids Research, 2014, 42(22): e166.

[31]Jiang, F.; Jin, Q.; Liang, L.; Zhang, A. B.; Li, Z. H.*.Existence of species complex largely reduced barcoding success for invasive species of Tephritidae: a case study in Bactrocera spp.Molecular Ecology Resources, 2014, 14(6): 1114-1128.

[32]He, Lijun*; Zhang, Aibing; Weese, David; Li, Shengfa; Li, Jiansheng; Zhang, Jing.Demographic response of cutlassfish (Trichiurus japonicus and T-nanhaiensis) to fluctuating palaeo-climate and regional oceanographic conditions in the China seas.Scientific Reports, 2014, 4: 6380.

[33]Liu, Xiao F.; Yang, Cong H.; Han, Hui L.; Ward, Robert D.; Zhang, Ai-bing*.Identifying species of moths (Lepidoptera) from Baihua Mountain, Beijing, China, using DNA barcodes.Ecology and Evolution, 2014, 4(12): 2472-2487.

[34]Yang, F.; Shi, Z. Y.; Bai, S. L.; Ward, R. D.; Zhang, A. B.*.Comparative studies on species identification of Noctuoidea moths in two nature reserve conservation zones (Beijing, China) using DNA barcodes and thin-film biosensor chips.Molecular Ecology Resources, 2014, 14(1): 50-59. 

[35]Huang, Jianhua; Zhang, Aibing; Mao, Shaoli; Huang, Yuan*.DNA Barcoding and Species Boundary Delimitation of Selected Species of Chinese Acridoidea (Orthoptera: Caelifera).PLos One, 2013, 8(12): e82400.

[36]van Asch, Barbara; Zhang, Ai-bing; Oskarsson, Mattias C. R.; Klutsch, Cornelya F. C.; Amorim, Antonio; Savolainen, Peter*.Pre-Columbian origins of Native American dog breeds, with only limited replacement by European dogs, confirmed by mtDNA analysis.Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences , 2013, 280(1766): 20131142.

[37]Jin, Qian and Han, Huilin and Hu, XiMin and Li, XinHai and Zhu, ChaoDong and Ho, Simon Y. W. and Ward, Robert D.;Zhang, Ai-bing.Quantifying Species Diversity with a DNA Barcoding-Based Method: Tibetan Moth Species (Noctuidae) on the Qinghai-Tibetan Plateau.PLOS ONE.2013,8(5)

[38]Zhang, A. B. and Muster, C. and Liang, H. B. and Zhu, C. D. and Crozier, R. and Wan, P. and Feng, J. and Ward, R. D.A fuzzy-set-theory-based approach to analyse species membership in DNA barcoding.Molecular Ecology, 2012, 21(8): 1848-1863. 

[39]Zhang, Ai-bing and Feng, Jie and Ward, Robert D. and Wan, Ping and Gao, Qiang and Wu, Jun and Zhao, Wei-zhong.A New Method for Species Identification via Protein-Coding and Non-coding DNA Barcodes by Combining Machine Learning with Bioinformatic Methods.PloS ONE, 2012, 7(2).

[40]Jin, Qian and He, Li-Jun and Zhang, Ai-Bing.A Simple 2D Non-Parametric Resampling Statistical Approach to Assess Confidence in Species Identification in DNA Barcoding-An Alternative to Likelihood and Bayesian Approaches.PLos One, 2012, 7(12).

[41]Dai, Qing-Yan and Gao, Qiang and Wu, Chun-Sheng and Chesters, Douglas and Zhu, Chao-Dong and Zhang, Ai-Bing.Phylogenetic reconstruction and DNA barcoding for closely related pine moth species (Dendrolimus) in China with multiple gene markers.PLos One, 2012, 7(4).

[42]Ardalan,A.; C. F. C. Kluetsch; A. B. Zhang; M. Erdogan; M. Uhlén; M. Houshmand; C. Tepeli; S. R. M. A.; P. Savolainen.Comprehensive study of mtDNA among Southwest Asian dogs contradicts independent domestication of wolf, but implies dog–wolf hybridization.Ecology and Evolution, 2011, 1(3): 373-385.

[43]Zhang, A. B.*; C. Muster; H.B. Liang; C.D. Zhu; R. Crozier; P. Wan; J. Feng; R. D. Ward.A fuzzy-set-theory-based approach to analyse species membership in DNA barcoding.Molecular Ecology, 2011, 1365-294X.

[44]He, Lijun;Zhang, Aibing;Zhu, Chaodong and Weese, David; Qiao, Zhenguo. Phylogeography of the mud crab (Scylla serrata) in the Indo-West Pacific reappraised from mitochondrial molecular and oceanographic clues: transoceanic dispersal and coastal sequential colonization. Marine Ecology,  2011, 32(1): 52-64.(SCI IF 1.56).（2011年發表）。

[45]Luo, Arong;Zhang, Aibing;Ho, Simon Y. W.; Xu, Weijun and Zhang, Yanzhou and Shi, Weifeng and Cameron, Stephen L. and Zhu, Chaodong. (2011). Potential efficacy of mitochondrial genes for animal DNA barcoding: a case study using eutherian mammals. BMC Genomics, 12:84. (SCI IF 3.76; 5Y IF 4.18).（2011年發表）。

[46]Lijun, He, Aibing, Zhang,Chaodong, Zhu,ianyi, Liu.Genetic Imprints of Paleo-oceanographic Conditions in the Chinese Seas: Population Bottlenecks of Scylla paramamosain and Periophthalmus modestus Inferred from Mitochondrial Genes.JOURNAL OF EARTH SCIENCE,2010,21(SI):237-240

[47]Zhang, A. B*, L. J. He , R. H Crozier, C. Muster, C.- D. Zhu*.（2010）. Estimating sample sizes for DNA Barcoding. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2010, 54(3): 1035-1039. (SCI IF 3.56; 5Y IF 4.04).

[48]Luo, Arong; Qiao, Huijie; Zhang, Yanzhou; Shi, Weifeng; Ho, Simon Y. W.; Xu, Weijun; Zhang, Aibing*; Zhu, Chaodong*（2010）. Performance of criteria for selecting evolutionary models in phylogenetics: a comprehensive study based on simulated datasets. BMC Evolutionary Biology,10:242.（IF 4.29； 5Y IF 4.56）.

[49]Feng, Jie; Hu, Yong; Wan, Ping; Zhang, Aibing; Zhao, Weizhong. (2010). New method for comparing DNA primary sequences based on a discrimination measure. Journal of Theoretical Biology. 2010, 266(4): 703-707.(SCI IF 2.57).

[50]He, Lijun; Zhang, Aibing; Weese, David; Zhu, Chaodong; Jiang, Chaojun; Qiao, Zhenguo. (2010). Late Pleistocene population expansion of Scylla paramamosain along the coast of China: a population dynamic response to the Last Interglacial sea level highstand. Journal of Experimental Marine Biology.2010, 385(1-2): 20-28.（IF 2.12； 5Y 2.44）.

[51]Jun-Feng Pang1,2 #, Cornelya Kluetsch3 #, Xiao-Ju Zou2 #, Ai-bing Zhang3 #(共同第一作者), Li-Yang Luo1,4, Helen Angleby3, Arman Ardalan3,5,6, Camilla Ekström3, Anna Sköllermo3, Joakim Lundeberg3, Shuichi Matsumura7,8, Thomas Leitner9, Ya-Ping Zhang1,2 *, Peter Savolainen3 *. (2009). mtDNA Data Indicates a Single Origin for Dogs South of Yangtze River, less than 16,300 Years Ago, from Numerous Wolves. Molecular Biology and Evolution, 26(12):2849-2864.(SCI IF 9.87; 5Y IF 8.22).

[52]Zhang, A. B*., D. S. Sikes, C. Muster, S. Q. Li*. (2008). Inferring Species Membership using DNA sequences with Back-propagation Neural Networks. Systematic Biology 57(2)：202-215. (SCI IF 8.48; 5Y IF 10.78; ranking 3/34 (Evolutionary Biology)).

[53]Zhang, A. B*. and P. Savolainen (2008). BPSI2.0: A C/C++ Interface Program for Species Identification via DNA Barcoding with a BP-Neural Network by calling the Matlab engine. Molecular Ecology Resources. 2008, 9(1): 104-106. (SCI IF 1.25).

[54]Zhang, A. B., and T. Sota. (2007). Nuclear gene sequences resolve species phylogeny and mitochondrial introgression in Leptocarabus beetles showing trans-species polymorphisms. Molecular Phylogenetic and Evolution, 2007, 45(2): 534-546. (SCI IF 3.56; 5Y IF 4.04).

[55]Zhang, A. B., S. J. Tan, and T.Sota (2006). AutoInfer1.0: a computer program to infer biogeographical events automatically. Molecular Ecology Notes 6(3): 597-599. (SCI IF 1.25).

[56]Zhang, A. B., K. Kubota, Y . Takami,J.L. Kim, J. K. Kim, and T. Sota. (2006). Comparative phylogeography of three Leptocarabus ground beetle species in South Korea, based on the mitochondrial COI and nuclear 28S rRNA genes. Zoological Science, 2006, 23(9): 745-754. (SCI IF 1.24).

[57]Zhang, A. B., K. Kubota, Y . Takami,J.L. Kim, J. K. Kim, and T. Sota. (2005). Species status and Phylogeography of two closely related Coptolabrus species (Coleoptera: Carabidae) in South Korea inferred from mitochondrial and nuclear genes sequences. Molecular Ecology, 2005, 14(12): 3823-3841. (SCI IF 5.96; 5Y IF 6.37;ranking 5/34 (Evolutionary Biology), 6/114 (Ecology)).

[58]Zhang, A. B., Kong, X.B, Li, D. M. (2004): DNA fingerprinting evidence for the phylogenetic relationship of eight species and subspecies of Dendrolimus (Lepidoptera: Lasiocampidae) in China. Acta Entomologica Sinica, 47 (2): 236-242.

[59]Zhang, A. B., Zhang, Z., Wang, H. B., Kong, X. B. (2004). Geographical distribution of Lasiocampidae in China and its relationship with environmental factors. Journal of Beijing Forestry University. 26(4): 54-60 (SCI, (EI)).

[60]Zhang, A. B., Li, D. M., Chen, J. (2004). Geohistories of Dendrolimus punctatus Walker and its host plant pine genus in China. Chinese Bulletin of Entomology. 2: 146-150.

[61]Wang, Z. J., Zhang, A. B., Li, D. M. (2003). Applied approaches and progress in the use of remote sensing techniques in insect ecology. Entomological Knowledge, 40(2): 97-100.

[62]Zhang, A. B., Wang, Z. J., Tan, S.J. and Li, D.M. (2003). Monitoring the masson pine moth, Dendrolimus punctatus （Walker）（Lepidoptera: Lasiocampidae with synthetic sex pheromone-baited traps in Qianshan County, China. Applied Entomology and Zoology, 2003, 38(2): 177-186. （SCI IF 0.45 0.77） 

[63]Wang, Z. J., Liu, Z. B., Zhang, A. B. Li, D. M. (2003). Ethogram and labor division in the carpenter ant Componotus tonkinus. Acta Entomologica Sinica, 46(2): 196-200.

[64]Zhang, A. B., Tan, S. J., Chen, J. & Li, D. M. (2002). Spatial Molecular Ecology: A new cross-discipline between Molecular Ecology and Spatial Ecology. Acta Ecologica Sinica, 22: 752-769.

[65]Zhang, A. B., Tan, S. J, Wang, Z. J. and Li, D. M. (2002). The important concept of Molecular Ecology - genetic distance and its measuring. Acta Ecologica Sinica, 22: 943-949.

[66]Zhang, A. B., Wang, Z. J & Li, D. M. (2002): Application of BP model and LOGIT model to prediction of forest insect pest occurrence. Acta Ecologica Sinica, 21: 2159-2165.

[67]Zhang, A. B., Tan, S.J., Gao, W., Li, D.M. (2001). Primary report on monitoring Dendrilimus punctatus (Walk)(Lepidoptera:Lasiocamidae) with synthetic sex pheromone in Qianshan County, Anhui province, in China. Entomological Knowledge, 38(3): 223-226.

[68]Zhang, A. B., Li, D. M.& Chen, J. (2001): Influence of foods on the growth and development of Misuemenops tricuspidatus. Acta Arachnologica Sinica, 10 (1): 26-29.

[69]Tan, S. J., Chen, X. F. and ;Zhang, A.B. (2001). Isolation and characterization of DNA microsatellite from cotton bollworm (Helicoverpa armigera, Hubner). Molecular Ecology Notes, 2001, 1(4): 243-244. (SCI IF 1.25).

[70]Zhang, A. B., Su, J. L., Zhang, J. X., Chen, J. (1999). Influence of foods on the growth and development of Misuemenops tricuspidatus: II. On nutritious index of M. tricuspidatus. Acta Arachnologica Sinica, 8(2): 76-79.

[71]Chen, J., Zhang, A. B., Xing, S. Y., Su, J. L. (1999). Influence of foods on the growth and development of Misuemenops tricuspidatus: I. On duration and dry body weight of M. tricuspidatus. Acta Arachnologica Sinica, 8(1): 34-37.

[72]Lui, Z. C., Zhang, A. B., Chen, W. H. (1999). Effect of Temperature on the experimental population increase of Pardosa Astrigena (Arachnia, Araneae). Acta Arachnologica Sinica, 8(1): 41-43.

[73]Zhang, A. B., Chen, J. (1998). A kind of ant-like spider - ant spider. Bulletin of Biology. 33(9): 12-13. 

發表期刊論文：

[1]王瑛, 楊采青, 王麗麗, 張露, 張愛兵. 菜粉蝶及其近緣種東方菜粉蝶全球潛在分布區預測[J]. 生態學報, 2024, 44 (18): 8185-8195.

[2]石林云, 張亞寧, 江廷磊, 楊采青, 孫成, Alice Catherine Hughes, 張愛兵. 草地貪夜蛾對新入侵地區蝙蝠超聲波脅迫的行為反應和轉錄組分析[J]. 生態學報, 2024, 44 (20): 8984-8995.

[3]馮丹丹, 張雪, 楊采青, 李晶, 張愛兵. 綠帶閉目天蛾和構月天蛾在海南島及周邊大陸的遺傳分化[J]. 生態學報, 2024, 44 (11): 4904-4913.

[4]王慧敏, 仝志斌, 張愛兵, 楊美玲. 昆蟲幾丁質代謝通路及其調控機制研究進展[J]. 首都師范大學學報(自然科學版), 2024, 45 (04): 11-19+28.

[5]王宸越, 韓瑛, 周振宇, 吳俊, 李晶, 張愛兵. 刺蛾科昆蟲翅脈結構初步分析[J]. 首都師范大學學報(自然科學版), 2024, 45 (04): 3-10.

[6]王麗麗, 楊采青, 王瑛, 李欣海, 萬方浩, 張愛兵. 全球入侵物種馬鈴薯塊莖蛾生態位轉移及適生區擴展[J]. 應用生態學報, 2024, 35 (03): 797-805.

[7]張曉曼, 張愛兵. 基于多重PCR技術的高通量測序在植食性昆蟲食譜鑒定中的潛在應用[J]. 植物保護學報, 2023, 50 (04): 858-865.

[8]何昕峪, 吳宇, 王慧敏, 張愛兵. 草地貪夜蛾聽覺基因Cut和Spalt時空表達分析及其功能研究[J]. 應用昆蟲學報, 2023, 60 (04): 1170-1180.

[9]楊樂樂, 段琛媛, 李晶, 孟凡華, 曹瑛, 代先東, 張愛兵, 范崇旭. 褐邊綠刺蛾幼蟲刺毛結構及蟄傷機制初探[J]. 環境昆蟲學報, 2022, 44 (01): 221-228.

[10]郝慧佳, 韓紅香, 楊采青, 江翀, 郝夢迪, 王正軍, 張愛兵. 海南自然保護區尺蛾科昆蟲β多樣性的研究[J]. 環境昆蟲學報, 2022, 44 (05): 1053-1062.

[11]金倩, 張天芯, 張智慧, 王飛飛, 王夏雯, 王信海, 張愛兵. 環境及地理因素對中國枯葉蛾科昆蟲β多樣性格局的影響[J]. 環境昆蟲學報, 2019, 41 (06): 1196-1207.

[12]焦萌, 李晶, 趙慧峰, 武春生, 張愛兵. 基于在線數據庫的鱗翅目刺蛾科昆蟲物種多樣性及其全球分布格局[J]. 生物多樣性, 2019, 27 (07): 778-786.

[13]李晶, 楊采青, 武春生, 張愛兵. 北京及周邊地區刺蛾科昆蟲系統發育多樣性研究[J]. 應用昆蟲學報, 2019, 56 (02): 234-244.

[14]金倩, 阮倩倩, 陳芬, 劉博, 蔡衛佳, 張愛兵. 青藏高原地區不同環境條件下鱗翅目昆蟲物種多樣性與系統發育多樣性的初步研究[J]. 環境昆蟲學報, 2018, 40 (01): 102-110.

[15]金倩, 阮倩倩, 陳芬, 羅桂杰, 張愛兵. DNA條形碼專用R包及其主要功能簡介[J]. 環境昆蟲學報, 2017, 39 (03): 485-492.

[16]張曉曼, 張愛兵. DNA條形碼及其在植食性昆蟲食性鑒定中的應用[J]. 昆蟲學報, 2017, 60 (01): 104-119.

[17]金倩, 武春生, 陳芬, 羅桂杰, 蔡衛佳, 劉旭, 楊采青, 郝夢迪, 張愛兵. 基于DNA條形碼的物種界定算法比較研究——以北京周邊地區舟蛾科為例[J]. 應用昆蟲學報, 2017, 54 (01): 13-21.

[18]金倩, 陳芬, 羅桂杰, 蔡衛佳, 劉旭, 王昊, 楊采青, 郝夢迪, 張愛兵. 基于DNA條形碼的物種豐富度估計:以宿遷地區鱗翅目蛾類為例[J]. 生物多樣性, 2016, 24 (11): 1296-1305.

[19]劉曉楓, 張愛兵. 分子鐘假說的基本原理及在古生物等學科中的應用[J]. 古生物學報, 2016, 55 (03): 393-402.

[20]楊帆, 黃立華, 張愛兵. 高通量轉錄組測序技術及其在鱗翅目昆蟲上的應用[J]. 昆蟲學報, 2014, 57 (08): 991-1000.

[21]宋韶彬, 楊聰慧, 張愛兵. 松毛蟲的生物防治[J]. 生物學通報, 2014, 49 (05): 1-3+64.

[22]宋韶彬, 石志勇, 金倩, 韓輝林, 劉曉楓, 郝夢迪, 張愛兵. DNA條形碼技術在河北保定、廊坊地區鱗翅目昆蟲上的應用及小型區域數據庫的構建[J]. 應用昆蟲學報, 2014, 51 (01): 156-168.

[23]朱琰, 史宗岡, 張愛兵, 任東. 中國東北中生代安紐蝎蛉總科研究進展[J]. 動物分類學報, 2013, 38 (02): 398-406.

[24]楊聰慧, 金倩, 陳付強, 武春生, 張愛兵. 基于進化樹、距離和特征的DNA條形碼方法研究——以百花山地區草螟科為例[J]. 應用昆蟲學報, 2013, 50 (01): 61-70.

[25]金倩, 張愛兵. 昆蟲DNA條形碼分析中的距離方法[J]. 應用昆蟲學報, 2013, 50 (01): 283-287.

[26]秦潔, 張愛兵. 昆蟲系統發育重建的常用方法及步驟[J]. 應用昆蟲學報, 2013, 50 (01): 288-292.

[27]李俊, 韓輝林, 高強, 金倩, 遲美妍, 武春生, 張愛兵. 支持向量機和鄰接法在夜蛾科昆蟲條碼研究中的應用[J]. 生物安全學報, 2012, 21 (04): 308-314.

[28]遲美妍, 韓輝林, 高強, 楊聰慧, 金倩, 李俊, 陳付強, 武春生, 張愛兵. 以霧靈山夜蛾科為材料評估進化模型對DNA條碼分類的影響[J]. 昆蟲學報, 2012, 55 (10): 1193-1204.

[29]楊聰慧, 韓輝林, 遲美妍, 金倩, 武春生, 朱朝東, 張愛兵. DNA條形碼技術在北京百花山地區夜蛾科物種鑒定中的應用[J]. 昆蟲學報, 2012, 55 (09): 1082-1092.

[30]程鵬, 張愛兵, 王忠鎖. 微型DNA條形碼在魚類識別上的應用[J]. 首都師范大學學報(自然科學版), 2012, 33 (02): 47-52.

[31]劉慎思, 張桂芬, 武強, 張愛兵, 王進軍, 萬方浩. 桔小實蠅幼體及成蟲殘體DNA條形碼識別技術的建立與應用[J]. 昆蟲學報, 2012, 55 (03): 336-343.

[32]喬瑋娜, 萬方浩, 張愛兵, 閔亮, 張桂芬. DNA條形碼技術在田間常見薊馬種類識別中的應用[J]. 昆蟲學報, 2012, 55 (03): 344-356.

[33]楊帆, 何利軍, 雷光春, 張愛兵. 中國東南沿海彈涂魚科常見魚類的遺傳多樣性和DNA條形碼[J]. 生態學雜志, 2012, 31 (03): 676-683.

[34]楊帆, 雷光春, 張愛兵*. DNA條形碼技術及其在保護生物學中的應用[J]. 生物技術通報, 2011, (05): 58-63.

[35]程鵬, 張愛兵*. 生命條形碼新秀:DNA微型條形碼技術[J]. 生物安全學報, 2011, 20 (01): 77-80.

[36]張愛兵; 張真; 王鴻斌; 孔祥波.中國枯葉蛾科昆蟲地理分布及其與環境的相關性.北京林業大學學報, 2004, 26(4): 54-60. 

[37]張愛兵; 孔祥波; 李典謨; 劉友樵.中國松毛蟲屬八個種和亞種親緣關系的DNA指紋證據.昆蟲學報, 2004, 47(2): 236-242.

[38]張愛兵; 李典謨; 陳建; 張真.馬尾松毛蟲及其寄主松屬植物的地史初步考證.昆蟲知識, 2004, 41(2): 146-149.

[39]正軍; 劉志斌; 張愛兵; 李典謨.金毛弓背蟻行為譜與社會分工的研究.昆蟲學報, 2003, 46(2): 196-200.

[40]王正軍; 張愛兵; 李典謨.遙感技術在昆蟲生態學中的應用途徑與進展.昆蟲知識, 2003, 40(2): 97-100.

[41]張愛兵; 王正軍; 譚聲江; 李典謨.分子生態學重要概念——遺傳距離及其測度的理論研究概況.生態學報, 2002, 22(6): 943-949.

[42]張愛兵; 譚聲江; 陳建; 李典謨.空間分子生態學——分子生態學與空間生態學相結合的新領域.生態學報, 2002, 22(5): 752-769. 

[43]王正軍; 張愛兵; 程家安; 李典謨.基于GIS的種群動態的時空分析與模擬研究的方法進展.生態學報, 2002, 22(1): 104-110. 

[44]張愛兵; 陳建; 王正軍; 李典謨; 田潔.BP網絡模型和LOGIT模型在森林害蟲測報上的應用初報——以安徽省潛山縣馬尾松毛蟲為例.生態學報, 2001, 21(12): 2159-2165.

[45]張愛兵; 譚聲江; 高偉; 李典謨; 涂金波; 汪赟; 郝強; 程蘭生; 陳立明.應用性外激素監測馬尾松毛蟲(枯葉蛾科)發生數量的初步研究.昆蟲知識, 2001, 38(3): 211-214.

[46]張愛兵; 李典謨; 陳建.食物中某些營養組分對三突花蛛生長發育的影響  蛛形學報, 2001, 10(1): 26-29.

[47]張愛兵; 蘇金玲; 張劍軒; 陳建.食物對三突花蛛生長發育的影響II.食物對三突花蛛營養指標的影響.蛛形學報, 1999, 8(2): 76-79.

[48]陳建; 張愛兵; 邢沈陽; 蘇金玲.食物對三突花蛛生長發育的影響I.食物對三突花蛛歷期和體重的影響.蛛形學報, 1999, 8(1): 34-37.

[49]張愛兵; 陳建.酷似螞蟻的蜘蛛——蟻蛛.生物學通報, 1998, 33(9): 12-13.

會議論文：

1 基于COⅠ基因部分序列對松毛蟲屬(鱗翅目,枯葉蛾科)八種松毛蟲分子系統關系及相關問題的探討 賈玉迪; 孔祥波; 張真; 王鴻斌; 張愛兵 第三屆中國森林保護學術大會 中國會議 2010-09-27

2 我國基層測報工作中幾個問題的探討 王正軍; 張愛兵; 李典謨 中國科學院動物研究所農業蟲鼠害綜合治理研究國家重點實驗室; 中國科學院動物研究所農業蟲鼠害綜合治理研究國家重點實驗室 【會議】昆蟲學創新與發展——中國昆蟲學會2002年學術年會論文集 2002-06-30

 

榮譽獎勵：

1、國家杰出青年基金獲得者。

2、北京市百千萬人才工程入選者。

中國教育網訊：首都師范大學生命科學學院"遺傳多樣性與進化課題組"最近在PLoS ONE（《公共科學圖書館.綜合》IF = 4.4，5Y IF = 4.6）上連續在線發表兩項DNA 條碼研究新成果：一種聯合運用機器學習和生物信息學進行編碼和非編碼區DNA條碼物種識別的新方法（"A New Method for Species Identification via Protein-Coding and Non-Coding DNA Barcodes by Combining Machine Learning with Bioinformatic Methods."http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0030986；2012年2月20日在線）和基于多基因條碼標記的中國松毛蟲屬近緣種的系統發育研究（"Phylogenetic reconstruction and DNA barcoding for closely related pine moth species (Dendrolimus) in China with multiple gene markers"http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0032544；2012年4月3日在線），前者由生命科學學院張愛兵教授完成，后者由張教授指導的2009級碩士研究生戴情燕同學完成。

公共科學圖書館（PLoS）是一家由眾多諾貝爾獎得主和慈善機構支持的非贏利性學術組織，旨在推廣世界各地的科學和醫學領域的最新研究成果。PLoS出版了8種生命科學與醫學領域的開放獲取期刊，在國際上享有很高的知名度和很強的學術影響力。2006 年12月20日，PLoS創建了PLoS ONE綜合性在線期刊，作為一個高水平的綜合性期刊，PLoS ONE十分注重文章學術質量，在理論編輯部監督下，該雜志出版的論文都是經過同行的嚴格審閱，期刊涵蓋范圍廣泛，為新興交叉學科提供高水平的交流平臺。

張愛兵教授的研究將機器學習與生物信息學方法結合起來，有效解決了非編碼DNA條碼標記進行序列對齊困難的問題，能夠顯著提高非編碼DNA條碼標記的物種識別成功率，戴情燕同學的研究運用了不同的DNA條碼標記探討了近緣物種的分子系統發育關系，及DNA條碼在近緣物種分子識別中的效率，進一步證實了標準的動物條碼基因COI在近緣種中的有效性，該項研究是繼張愛兵教授將人工智能方法（Syst.Biol. 2008, SCI IF 9.53; 5Y IF 11.15）與模糊數學理論（Mol. Ecol. 2012. SCI IF 6.45； 5Y IF 6.63）引入到國際DNA條碼研究領域后的一項重要應用研究。

張愛兵教授系我校“海外引進人才”，現為生命科學學院生態學學科帶頭人，博士生導師，其研究團隊致力于動物遺傳多樣性、DNA分子分類學原理與應用、分子生態學（分子譜系地理學）、比較基因組學、進化與系統發育重建、害蟲分子識別的研究，其課題組相關研究成果曾發表于Molecular Biology and Evolution， Molecular Ecology，Molecular Phylogenetic and Evolution，BMC Genomics，BMC Evolutionary Biology等國際核心期刊。

課題組網頁：http://202.204.209.200/shizishow.php?idh=493.

附：PloS ONE 兩篇科研論文發表即受到較高的關注：595個瀏覽量（2012年2月20日在線）和235個瀏覽量（發表后3天：2012年4月3日-6日），以下為該期刊的瀏覽量統計。

首都師范大學生命科學學院張愛兵教授發表重要學術成果

 

近日首都師范大學生科院張愛兵教授在著名的進化、生態學國際期刊《molecular Ecology》上發表了DNA條形碼研究新成果。

 

DNA條形碼研究是國際生態學、進化生物學領域新興的交叉研究領域(分子生物學，經典分類學，生態學以及計算機科學的交叉)，由加拿大科學家P.Hebert于2003年提出，在國際生物學相關領域引起廣泛關注。DNA條形碼研究極大地促進了生物多樣性保護、外來入侵和有害生物分子識別等相關領域的研究。

在這篇文章中，張教授將模糊數學理論引入到DNA條形碼研究領域，提出了基于模糊成員關系與最小遺傳距離的DNA物種識別新方法。他通過實例研究和超過5000次的計算機模擬，證明該方法明顯優于常用的基于Bayesian理論的方法和基于NJ建樹的方法，尤其能夠降低DNA條形碼識別中的假陽性錯誤。

張愛兵教授系首都師范大學“海外引進人才”，現為首都師范大學生命科學學院分子生態學學科帶頭人，博士生導師。其領導的研究團隊致力于DNA條形碼理論與應用、有害生物的分子識別和生態安全，目前承擔有國家自然科學基金面上項目等，是國際DNA條形碼理論研究領域少數幾個研究團隊之一，在相關領域具有較強的國際影響力。

此研究是張愛兵教授繼2008年將人工智能的思想引入到DNA條形碼(DNA barcoding)研究領域后，在該領域內取得的又一次理論突破。

原文摘要： 

A fuzzy-set-theory-based approach to analyse species membership in DNA barcoding

ReliABLe assignment of an unknown query sequence to its correct species remains a methodological problem for the growing field of DNA barcoding. While great advances have been achieved recently, species identification from barcodes can still be unreliable if the relevant biodiversity has been insufficiently sampled. We here propose a new notion of species membership for DNA barcoding—fuzzy membership, based on fuzzy set theory—and illustrate its successful application to four real data sets (bats, fishes, butterflies and flies) with more than 5000 random simulations. Two of the data sets comprise especially dense species/population-level samples. In comparison with current DNA barcoding methods, the newly proposed minimum distance (MD) plus fuzzy set approach, and another computationally simple method, ‘best close match’, outperform two computationally sophisticated Bayesian and BootstrapNJ methods. The new method proposed here has great power in reducing false-positive species identification compared with other methods when conspecifics of the query are absent from the reference database.

組長(PI)簡介：

張愛兵,博士,教授,博士生導師,海外引進人才,分子生態學學科帶頭人,生態學教研室主任。《生物安全學報》編委;日本進化學會會員(2006～2007年);國際期刊Molecular Ecology(IF6.45;5Y IF6.63)和Ecology Letters(IF15.25;5Y IF14.26)分子譜系地理學、DNA分子分類方向評審專家。主要學術經歷:2007～2009年,瑞典皇家工學院,博士后,研究方向為分子譜系地理學;開發DNA分子分類軟件BPSI2.0。2006年10～12月,中科院動物研究所,動物進化與系統學重點實驗室,助研,從事DNA分子分類學研究。2003～2006年,日本京都大學,博士后,研究方向是東亞地區(韓國、日本、中國)昆蟲分子系統學,分子譜系地理學。1999～2003年,首都師范大學生命科學學院遺傳多樣性與進化課題組<正>組長(PI)簡介:張愛兵,博士,教授,博士生導師,海外引進人才,分子生態學學科帶頭人,生態學教研室主任。《生物安全學報》編委;日本進化學會會員(2006～2007年);國際期刊Molecular Ecology(IF6.45......